Ungeachtet ihrer gegenteiligen Versicherungen halten die Cardassianer nach wie vor Bajoraner in ihren Arbeitslagern gefangen. Major Kira überfällt gemeinsam mit O'Brien - offenbar ohne Erlaubnis der Sternenflotte - ein solches Lager und befreit die Gefangenen, unter denen sich auch ein totgeglaubter Kriegsheld befindet. Dieser und Kira schaffen es nur knapp den Kreis, eine Untergrundbewegung, die die provisorische Regierung stürzen will, aufzuhalten.
Nach einigen Abenteuern mit fremden Rassen aus dem Gamma-Quadranten und den Klingonen treten die "Maquis", die von abtrünnigen Sternenflotten-Offizieren angeführt werden und die einen Untergrundkampf gegen die Cardassianer führen, in den Vordergrund. Die Maquis beschäftigten bereits die Crew der Enterprise.
Die hinterhältige Vedek Winn wird durch ihre Intrigen die neue Kai von Bajor.