Am Ende der 7. Staffel entdeckt Seven Unimatrix Zero, eine virtuelle Welt, die innerhalb des Kollektivs besteht und wo tausende von Borg frei leben können. Doch nun ist die Borgkönigin auf der Suche nach der Frequenz, mit der die Verbindung zur Unimatrix aufrecht gehalten wird. Sie will eine Revolution im Kollektiv verhindern. Zwar wird Unimatrix Zero zerstört, doch Captain Janeway gelingt es im letzten Moment den freien Borg daraus zu retten.
B'Elanna erwartet ein Kind von ihrem Ehemann Tom Paris, doch auch das bleibt nicht ohne Komplikationen.
In der letzen Staffel verläst Neelix das Schiff, um bei seinem eigenen Volk zu leben und auch die Crew der Voyager schafft es endlich einen Weg nach Hause zu finden. Doch vorher müssen noch einige Abenteuer bestanden und die Borgkönigin besiegt werden.